El género Cryptosporidium pertenece a la familia Cryptosporidiidae y es un protozoo parásito del filo Apicomplexa. Cryptosporidium incluye más de 25 especies la mitad de las cuales son potencialmente capaces de infectar las personas y los animales domésticos. Aunque 26 especies se han asociado a la infección humana, 2 son responsables de la mayoría de los casos: C. hominis y C. parvum.
Su ciclo vital no incluye huéspedes intermediarios, ya que la infección se puede producir de manera orofecal directa, o a través del agua o los alimentos contaminados. La dosis infectiva es variable según la especie y el huésped.
La forma infectante del parásito son los oocistos, los cuales se excretan con los excrementos de los huéspedes infectados. Estos oocistos se pueden encontrar en aguas superficiales y en suelos contaminados; y, las condiciones climáticas, incluido el cambio climático, pueden favorecer su difusión, incrementando así el riesgo de infección, especialmente en niños y en poblaciones vulnerables en las zonas urbanas.
Los oocistos de Cryptosporidium son muy resistentes y pueden sobrevivir periodos prolongados en condiciones de humedad y frío, que son las que se producen en el almacenaje de productos frescos; resisten las concentraciones habituales de cloro en el tratamiento del agua y son sensibles a la desecación, el calor, la congelación, la radiación ultravioleta y a varios tratamientos químicos.
La supervivencia de los oocistos en el medio acuático está influenciada, entre otras causas, por la temperatura. En general, temperaturas más altas y una mayor exposición a la luz solar reducen la viabilidad de los oocistos. La supervivencia es mejor a temperaturas entre 4 °C y 20 °C. Los oocistos de Cryptosporidium son viables e infecciosos en el agua y el excremento hasta seis meses a temperaturas entre 0 y 30 ° C y hasta un año en agua de mar. A temperaturas superiores a 30 °C, la viabilidad de los oocistos disminuye rápidamente, y a temperaturas por encima de 60 °C, los oocistos se destruyen. Por el contrario, temperaturas de -20 ºC durante 5 días inactivan el 80%, y en -70 ºC, inactivan los oocistos directamente.